Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb2Q08331 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calb2Q08331 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calb2Q08331 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calb2Q08331 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calb2Q08331 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms