Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gdf3Q07104 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms