Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPINDOCQ05AH6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPINDOCQ05AH6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms