Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms