Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fmn1Q05860 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms