Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hspg2Q05793 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms