Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms