Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms