Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nf1Q04690 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nf1Q04690 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms