Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms