Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb5Q02739 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms