Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms