Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms