Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ly9Q01965 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms