Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms