Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sec23aQ01405 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms