Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Top2aQ01320 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms