Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EgfrQ01279 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms