Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms