Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GabpaQ00422 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GabpaQ00422 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GabpaQ00422 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GabpaQ00422 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GabpaQ00422 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GabpaQ00422 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GabpaQ00422 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GabpaQ00422 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GabpaQ00422 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GabpaQ00422 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms