Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp9bP98195 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp9bP98195 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms