Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms