Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama4P97927 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama4P97927 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama4P97927 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama4P97927 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms