Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp6P97868 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbbp6P97868 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp6P97868 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp6P97868 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp6P97868 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp6P97868 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp6P97868 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp6P97868 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp6P97868 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp6P97868 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp6P97868 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp6P97868 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp6P97868 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms