Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AlkP97793 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AlkP97793 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AlkP97793 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AlkP97793 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AlkP97793 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AlkP97793 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AlkP97793 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AlkP97793 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AlkP97793 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AlkP97793 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AlkP97793 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AlkP97793 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AlkP97793 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AlkP97793 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AlkP97793 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AlkP97793 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AlkP97793 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AlkP97793 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AlkP97793 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AlkP97793 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AlkP97793 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AlkP97793 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AlkP97793 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AlkP97793 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AlkP97793 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AlkP97793 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AlkP97793 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AlkP97793 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AlkP97793 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AlkP97793 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AlkP97793 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AlkP97793 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AlkP97793 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlkP97793 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
AlkP97793 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
AlkP97793 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlkP97793 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlkP97793 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlkP97793 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlkP97793 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlkP97793 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlkP97793 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlkP97793 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlkP97793 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlkP97793 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AlkP97793 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AlkP97793 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AlkP97793 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AlkP97793 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AlkP97793 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AlkP97793 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AlkP97793 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AlkP97793 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AlkP97793 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AlkP97793 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AlkP97793 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AlkP97793 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AlkP97793 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AlkP97793 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AlkP97793 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AlkP97793 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AlkP97793 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AlkP97793 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AlkP97793 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AlkP97793 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AlkP97793 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
AlkP97793 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AlkP97793 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AlkP97793 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AlkP97793 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AlkP97793 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AlkP97793 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms