Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas1P97459 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms