Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nbr1P97432 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nbr1P97432 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nbr1P97432 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nbr1P97432 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nbr1P97432 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nbr1P97432 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Nbr1P97432 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nbr1P97432 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nbr1P97432 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nbr1P97432 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nbr1P97432 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nbr1P97432 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nbr1P97432 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nbr1P97432 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nbr1P97432 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nbr1P97432 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nbr1P97432 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nbr1P97432 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nbr1P97432 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nbr1P97432 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nbr1P97432 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nbr1P97432 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nbr1P97432 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nbr1P97432 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nbr1P97432 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nbr1P97432 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nbr1P97432 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nbr1P97432 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nbr1P97432 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nbr1P97432 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nbr1P97432 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nbr1P97432 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nbr1P97432 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nbr1P97432 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nbr1P97432 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nbr1P97432 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms