Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LystP97412 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LystP97412 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LystP97412 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LystP97412 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LystP97412 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LystP97412 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LystP97412 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LystP97412 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LystP97412 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LystP97412 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LystP97412 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LystP97412 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LystP97412 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LystP97412 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LystP97412 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LystP97412 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LystP97412 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LystP97412 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LystP97412 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LystP97412 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LystP97412 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LystP97412 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LystP97412 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LystP97412 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LystP97412 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LystP97412 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LystP97412 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LystP97412 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LystP97412 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LystP97412 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LystP97412 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LystP97412 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LystP97412 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LystP97412 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LystP97412 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LystP97412 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LystP97412 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LystP97412 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LystP97412 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LystP97412 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LystP97412 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LystP97412 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LystP97412 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LystP97412 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LystP97412 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LystP97412 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms