Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms