Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nucb2P81117 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nucb2P81117 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms