Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms