Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms