Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tp53bp1P70399 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tp53bp1P70399 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms