Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms