Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms