Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf5P70191 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf5P70191 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf5P70191 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf5P70191 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms