Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Barhl1P63157 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms