Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtnP63089 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtnP63089 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtnP63089 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtnP63089 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtnP63089 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtnP63089 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtnP63089 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtnP63089 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtnP63089 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtnP63089 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtnP63089 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtnP63089 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtnP63089 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtnP63089 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtnP63089 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtnP63089 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtnP63089 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtnP63089 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtnP63089 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtnP63089 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtnP63089 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms