Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3P62908 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rps3P62908 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms