Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms