Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms