Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SnrpfP62307 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SnrpfP62307 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms