Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms