Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga11P61622 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga11P61622 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms