Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd6P61407 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tdrd6P61407 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms