Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg6P61406 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg6P61406 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg6P61406 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg6P61406 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg6P61406 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg6P61406 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg6P61406 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg6P61406 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg6P61406 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg6P61406 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg6P61406 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms