Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf3P61205 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf3P61205 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms