Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms