Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Romo1P60603 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms