Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcif1P59114 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms